鄂尔多斯市地貌复杂多样，北部为黄河冲积平原区，东部为丘陵沟壑区，中部有库布其、毛乌素沙区，西部为坡状高原区，西南为草原区，气候条件恶劣,湿地类型以荒漠湖泊为主。

2008年6月16日起鄂尔多斯遗鸥国家级自然保护区管理局对鄂尔多斯市境内的湿地进行了调查。